Yasmin Binti Shamsudin
Forskare vid Institutionen för kemi - BMC, Biokemi; Binti Shamsudin grupp
- E-post:
- yasmin.shamsudin[AT-tecken]kemi.uu.se
- Besöksadress:
- Husargatan 3
752 37 Uppsala - Postadress:
- Box 576
75123 Uppsala
Kort presentation
Jag forskar om hur proteiner och små molekyler samspelar med varandra och hur deras strukturer bidrar till deras funktioner i kroppen. Genom molekylmodellering och molekyldynamiksimuleringar försöker jag förstå de underliggande mekanismerna som reglerar inbindning, hämning och katalys av ligander i proteiner. Genom att jämföra beräkningar med experiment kan vi sedan skapa metoder och modeller som vi kan använda för att förutsäga funktionaliteten hos andra molekyler, små som stora.
Nyckelord: antibiotics enzyme inhibitors molecular dynamics molecular modelling enzyme catalysis antibacterial inhibitors electric fields free energy calculations protein engineering
Genom att kombinera olika modellerings-, simulerings-, och beräkningsmetoder försöker jag förstå de underliggande mekanismerna som reglerar inbindning, hämning och katalys i biomolekyler för design av nya läkemedel. Jag är också intresserad av design av funktionella proteiner.
Jag har jobbat med flera biologiska system och projekt, exempelvis
- antiinflammatoriska ickesteroida hämmare (NSAID) som ibuprofen och diklofenak
- bindnings- och selektivitetsmekanismer i cyclooxygenaserna (COX) 1 och 2
- hämmare till insulinreglerade aminopeptidaser (IRAP)
- design av nya gröna fluorescensprotein (GFP)
- katalys i alkoholdehydrogenas i lever (LADH)
- antibiotika och betalaktamaser
Kontakta katalogansvarig vid den aktuella organisationen (institution eller motsv.) för att rätta ev. felaktigheter.